Los versátiles controles Joy-Con ofrecen a los jugadores múltiples nuevas maneras de divertirse. Dos controles Joy-Con pueden usarse independientemente en cada mano, o juntos como un solo control (cuando se encajan en el armazón para controles Joy-Con). También pueden colocarse en la consola para utilizarlos en el modo portátil o compartirlos con amigos para disfrutar de acción para dos jugadores en juegos compatibles. Cada control Joy-Con incluye un set completo de botones y puede actuar como un control separado, además cada uno cuenta con acelerómetro y giroscopio lo que hace posible el control por movimiento en cada uno de los controles de manera independiente.